Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Actrt1Q9D9J3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Actrt1Q9D9J3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms