Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cntd1Q9D995 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44 ms