Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Cnot8Q9D8X5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Cnot8Q9D8X5 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms