Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx5Q9D8U8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms