Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SlirpQ9D8T7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SlirpQ9D8T7 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms