Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo2Q9D8S4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo2Q9D8S4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo2Q9D8S4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rexo2Q9D8S4 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rexo2Q9D8S4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rexo2Q9D8S4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rexo2Q9D8S4 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Rexo2Q9D8S4 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rexo2Q9D8S4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms