Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S3

Arfgap3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap3Q9D8S3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Arfgap3Q9D8S3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap3Q9D8S3 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap3Q9D8S3 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap3Q9D8S3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap3Q9D8S3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap3Q9D8S3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap3Q9D8S3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap3Q9D8S3 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap3Q9D8S3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap3Q9D8S3 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap3Q9D8S3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap3Q9D8S3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap3Q9D8S3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap3Q9D8S3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap3Q9D8S3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap3Q9D8S3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Arfgap3Q9D8S3 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgap3Q9D8S3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arfgap3Q9D8S3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms