Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F3

Slc52a2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc52a2Q9D8F3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Slc52a2Q9D8F3 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Slc52a2Q9D8F3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc52a2Q9D8F3 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc52a2Q9D8F3 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc52a2Q9D8F3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc52a2Q9D8F3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc52a2Q9D8F3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc52a2Q9D8F3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc52a2Q9D8F3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc52a2Q9D8F3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc52a2Q9D8F3 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc52a2Q9D8F3 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc52a2Q9D8F3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc52a2Q9D8F3 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc52a2Q9D8F3 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc52a2Q9D8F3 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Slc52a2Q9D8F3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc52a2Q9D8F3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc52a2Q9D8F3 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc52a2Q9D8F3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Slc52a2Q9D8F3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms