Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.89■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Fip1l1Q9D824 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms