Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vstm5Q9D806 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms