Protein–RNA interactions for Protein: Q9D805

Capn9, Calpain-9, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn9Q9D805 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Capn9Q9D805 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Capn9Q9D805 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms