Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y1

Ccdc3, Coiled-coil domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc3Q9D6Y1 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Ccdc3Q9D6Y1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc3Q9D6Y1 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc3Q9D6Y1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc3Q9D6Y1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc3Q9D6Y1 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc3Q9D6Y1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc3Q9D6Y1 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc3Q9D6Y1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc3Q9D6Y1 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc3Q9D6Y1 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc3Q9D6Y1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc3Q9D6Y1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc3Q9D6Y1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc3Q9D6Y1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc3Q9D6Y1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc3Q9D6Y1 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc3Q9D6Y1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Ccdc3Q9D6Y1 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms