Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6I0

Rtl8c, Cxx1c protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl8cQ9D6I0 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rtl8cQ9D6I0 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Rtl8cQ9D6I0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rtl8cQ9D6I0 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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