Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Lpcat2bQ9D5U0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Lpcat2bQ9D5U0 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.4 ms