Protein–RNA interactions for Protein: Q9D516

Ccdc130, Coiled-coil domain-containing protein 130, mousemouse

Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc130Q9D516 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc130Q9D516 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms