Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Ccdc83Q9D4V3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ccdc83Q9D4V3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms