Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
4930578G10RikQ9D4Q4 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
4930578G10RikQ9D4Q4 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms