Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Efhd1Q9D4J1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms