Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Pus10Q9D3U0 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Pus10Q9D3U0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms