Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9D3J9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D3J9 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D3J9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D3J9 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D3J9 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D3J9 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D3J9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D3J9 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D3J9 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9D3J9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D3J9 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D3J9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D3J9 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D3J9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D3J9 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D3J9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D3J9 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D3J9 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9D3J9 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms