Protein–RNA interactions for Protein: Q9D387

Lamp5, Lysosome-associated membrane glycoprotein 5, mousemouse

Predictions only

Length 280 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp5Q9D387 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lamp5Q9D387 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms