Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Pramef12Q9D2F1 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Pramef12Q9D2F1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms