Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C9

Rrp7a, Ribosomal RNA-processing protein 7 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp7aQ9D1C9 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Rrp7aQ9D1C9 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rrp7aQ9D1C9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms