Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Susd3Q9D176 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms