Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tmem53Q9D0Z3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tmem53Q9D0Z3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms