Protein–RNA interactions for Protein: Q9D071

Mms19, MMS19 nucleotide excision repair protein homolog, mousemouse

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Length 1,031 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mms19Q9D071 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
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Mms19Q9D071 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mms19Q9D071 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mms19Q9D071 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mms19Q9D071 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mms19Q9D071 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mms19Q9D071 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mms19Q9D071 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mms19Q9D071 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mms19Q9D071 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mms19Q9D071 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mms19Q9D071 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mms19Q9D071 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mms19Q9D071 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mms19Q9D071 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mms19Q9D071 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mms19Q9D071 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Mms19Q9D071 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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Mms19Q9D071 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Mms19Q9D071 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Mms19Q9D071 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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Mms19Q9D071 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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Mms19Q9D071 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Mms19Q9D071 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Mms19Q9D071 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mms19Q9D071 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms