Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Exo5Q9CXP9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Exo5Q9CXP9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms