Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Sgo1Q9CXH7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sgo1Q9CXH7 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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