Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX00

Ist1, IST1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ist1Q9CX00 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ist1Q9CX00 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ist1Q9CX00 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms