Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Rpusd4Q9CWX4 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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