Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tdrd12Q9CWU0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tdrd12Q9CWU0 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms