Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP8

Pold4, DNA polymerase delta subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold4Q9CWP8 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pold4Q9CWP8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pold4Q9CWP8 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms