Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWD8

Nubpl, Iron-sulfur protein NUBPL, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NubplQ9CWD8 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NubplQ9CWD8 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms