Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
MINDY3Q9CV28 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
MINDY3Q9CV28 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms