Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUI2

4930535I16Rik, RIKEN cDNA 4930535I16 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930535I16RikQ9CUI2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.18□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.17□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.16□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.62
4930535I16RikQ9CUI2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 888.3 ms