Protein–RNA interactions for Protein: Q9CTN4

Rhobtb3, Rho-related BTB domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 611 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb3Q9CTN4 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rhobtb3Q9CTN4 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rhobtb3Q9CTN4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms