Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.02■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Atg12Q9CQY1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Atg12Q9CQY1 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms