Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ykt6Q9CQW1 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms