Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQK7

Rwdd1, RWD domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rwdd1Q9CQK7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Rwdd1Q9CQK7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rwdd1Q9CQK7 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms