Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQH0

Pdzk1ip1, PDZK1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzk1ip1Q9CQH0 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Pdzk1ip1Q9CQH0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Pdzk1ip1Q9CQH0 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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