Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD8

Atp6v0e1, V-type proton ATPase subunit e 1, mousemouse

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v0e1Q9CQD8 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
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Atp6v0e1Q9CQD8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Atp6v0e1Q9CQD8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Atp6v0e1Q9CQD8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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