Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Rab5aQ9CQD1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms