Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC0

Tpbpb, Trophoblast-specific protein beta, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TpbpbQ9CQC0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TpbpbQ9CQC0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TpbpbQ9CQC0 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms