Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Itgb3bpQ9CQ82 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Itgb3bpQ9CQ82 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms