Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ73

Pkp2, Plakophilin 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp2Q9CQ73 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Pkp2Q9CQ73 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Pkp2Q9CQ73 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms