Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ36

Pole4, DNA polymerase epsilon subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole4Q9CQ36 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pole4Q9CQ36 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms