Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPX6

Atg3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg3Q9CPX6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Atg3Q9CPX6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Atg3Q9CPX6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms