Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPU1

Ssxb1, MCG116417, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb1Q9CPU1 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ssxb1Q9CPU1 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ssxb1Q9CPU1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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