Protein–RNA interactions for Protein: Q99PV8

Bcl11b, B-cell lymphoma/leukemia 11B, mousemouse

Predictions only

Length 884 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11bQ99PV8 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Bcl11bQ99PV8 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Bcl11bQ99PV8 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms