Protein–RNA interactions for Protein: Q99PN3

Trim26, Tripartite motif-containing protein 26, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim26Q99PN3 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Trim26Q99PN3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Trim26Q99PN3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67 ms